驯服翼龙的核心在于使用流星锤或麻醉武器将其击晕，然后在其昏迷期间放入生肉等食物等待驯服进度完成，最后为其安装相应等级的鞍即可骑乘。你需要制作好流星锤、弹弓或弓箭等击晕工具，并备足麻醉箭或麻醉镖。务必提前收集大量生肉或优质生肉作为驯服食物，并准备麻醉药或从水母身上获取的生物毒素，以防止翼龙在驯服过程中提前苏醒逃跑。
最常用且高效的方法是使用流星锤，在靠近翼龙时迅速投出将其捆住，然后立即用木棒或麻醉武器攻击直至其眩晕倒地。如果选择远程武器，建议瞄准头部以提高击晕效率。翼龙警觉性很高，行动必须快速果断，一旦失手让它飞走，就需要等待其脱战后再尝试。
翼龙被击晕后，要立即打开它的物品栏，放入生肉、优质生肉或特制的饲料。食物放入后，它会自行取食，驯服进度条（黄条）会随之增长。切记不要进行强制喂食，因为强制喂食无法增加驯服进度，只会浪费食物。在整个过程中，你必须时刻监视翼龙的眩晕值（紫条），当其下降时，需要通过强制喂食麻醉药或黑果子来维持其昏迷状态，一旦眩晕值耗尽翼龙醒来，驯服就会失败。
成功驯服后，你还需要为翼龙装上对应的鞍才能骑乘。最常见的无齿翼龙需要玩家角色达到35级才能制作和使用其鞍具。安装好鞍具后，你就能骑乘翼龙进行飞行，极大地提升探索地图的效率。对于古神翼龙、风神翼龙等特殊种类，驯服方法有额外细节。古神翼龙异常警觉，穿着吉利服潜行靠近并使用流星锤是成功的关键，它喜欢吃异特龙蛋饲料。而驯服风神翼龙更为复杂，通常需要两人配合，一人骑乘飞行坐骑，另一人使用爪钩悬挂并用长管步枪发射麻醉镖将其击落，之后在地面完成驯服，且要绝对避免让它晕倒在水里。
