江南百景图中船运物资需先解锁码头与大地图，通过府印进入大地图点击空闲船只，选定目的地后调配物资与居民，出发后抵达目标城市码头收取货物，全程遵循人货分离、少量多次原则，搭配码头升级与特殊角色可大幅提升运输效率。
开启船运的前提是完成应天府码头修复并解锁苏州府等其他城市，点击界面左下角的应天府印，选择大地图功能，就能看到城市旁的空闲船只图标，点击后进入运输界面，先选定已解锁的目标城市，再滑动选择要运输的物资种类与数量，单次仅可运输一种物资，也可搭配两名居民一同出发，确认后点击出发，船只便会启航，运输途中大地图上的船只会显示所载物资图案，方便实时追踪进度。物资运输遵循每两份资源耗时一分钟的规则，运送居民则会额外增加固定航行时间，因此人货分离运输能最大化效率，避免混合运输拖慢整体节奏。
船只抵达目的地后，需切换到目标城市界面，在城外河道找到带有完成标识的小船，点击即可收取物资，若目的地仓库容量不足，剩余物资会留在船上，导致船只无法返航，因此单次运输量建议控制在6至8小时内抵达，既避免仓库爆满，也能保证出发地有充足物资支撑日常生产。码头升级是提升船运能力的关键，花费补天石将码头升至3级，可解锁第三条运输船，还能跨城运输建筑并无视建筑仓库容量，大幅拓展物资调配的灵活性。
船运搭配特殊角色与玩法能进一步优化体验，选用探险属性高的角色负责运输，可显著缩短航行时间，麦小满等角色还能在漕运玩法中提供额外收益，快速解锁新航路。扬州漕运玩法可通过船运获取铜钱、连票与码头材料，集齐连票能解锁更多航线，循环航行模式可让船只持续运转，每日收益更稳定。日常规划中，优先运输目标城市稀缺物资，如苏州缺木炭、杭州缺竹子，针对性调配能快速推进新城基建，避免资源浪费。
