赤壁之战是少年三国志零中极具策略性的核心玩法，玩家需达到41级后解锁。该玩法要求准备两套完整阵容（每组6-8名武将），通过合理布阵与兵种克制实现胜利。地形机制是核心策略点，包括可快速位移的船舱、造成范围伤害的地刺、禁止布阵的火焰区域、提供治疗帐篷以及攻击敌人的巨弩等，需根据战场环境动态调整战术。
兵种克制系统是通关的关键要素，游戏内六类兵种存在明确的相互制约关系。盾兵开场自带护盾，适合抗伤；重骑首次接战可造成高额破防伤害；弓手距离越远攻击越高；谋士能降低计谋伤害。轻骑对弓手和谋士有暴击加成，步兵需与近战部队协同触发攻击增益。布阵时需优先考虑敌方阵容弱点，例如面对多盾兵阵容时，可搭配破甲流武将或重骑突破防线。
推荐第一队以弓手为核心，搭配周瑜军师利用火攻增益，辅以前排盾兵保护；第二队可选择蜀国阵容，利用黄月英或水镜先生的控场技能，配合轻骑绕后突袭。联盟助战功能可弥补自身阵容缺陷，但需注意选择功能性武将而非单纯堆砌战力。战斗中需观察敌方军师技能释放时机，及时调整站位避免关键武将被控或集火。
高阶技巧包括利用器械效果扩大优势。治疗帐篷可维持持久战能力，巨弩能远程压制敌方后排，火焰区域可限制敌方走位。部分关卡需针对性策略，如面对多轻骑阵容时，需在两侧布置反制骑兵或集中火力速杀。武将培养方面，优先提升主力盾兵（如典韦、董卓）的生存能力，以及核心输出（如甘宁、孙尚香）的伤害属性，确保两套阵容均衡发展。
